为打造“感冒发烧不出村，常见多发病不出乡，大病尽量少出区”的医疗服务格局，目前，淮阴区已将所有乡（镇）卫生院和村卫生站都列为区域内新型农村合作医疗定点医疗服务机构，最大限度地方便参合群众就近就医，减少参合农民的就医经济压力，有效减少了广大农民因病致贫、因病返贫现象。

　　据统计，2011年该区参合农民达60.6万人，比上年增加2万人，参合率达100%，实现了新型农村合作医疗制度全覆盖。2011年度区财政部门积极向上级争取补偿金额达11274万元，为全区148.3万人次进行因病补偿，当年获得万元以上补偿的有1746人次，其中有4人得到最高封顶线12万元补偿金额。

　　为做好新型农村合作医疗资金运行管理工作，该区严格遵循“以收定支，收支平衡，专款专用，专户储存”的基金运行原则，设立新型农村合作医疗基金专户，实行封闭运行，做到管钱和管账分离。同时推行区内就诊“一卡通”、规范定点医疗机构服务行为、加强监督审计等措施。此外，将住院补偿封顶从12万元提高到15万元，还相应提高乡村医疗机构的医药费用补偿标准。此外，在全市率先建立合作医疗补偿回访制度、乡镇合作医疗管理人员例会制度、农民医药费用补偿网络结报制度等。

　　2012年全区新型农村合作医疗个人筹资工作已经全部结束。据统计，参合农民达62.9万人，比2011年度参合人数增加2.3万人，参合率达100%。